sars-cov-2

Open-source projects categorized as sars-cov-2
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Language: + Python + JavaScript + Jupyter Notebook + TypeScript + Makefile + HTML + C++ + Vue
Topics: covid-19 Coronavirus Covid19 Germany Covid
The modern identity platform for B2B SaaS
The APIs are flexible and easy-to-use, supporting authentication, user identity, and complex enterprise features like SSO and SCIM provisioning.
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Top 23 sars-cov-2 Open-Source Projects

  • covid-19-data

    Data on COVID-19 (coronavirus) cases, deaths, hospitalizations, tests • All countries • Updated daily by Our World in Data (by owid)

    Project mention: COVID no longer a global health emergency, World Health Organisation says | /r/Coronavirus | 2023-05-05

    Finally! This is the right thing to do. COVID-19 now kills only 378 people each day globally (7-day rolling average, Source: https://ourworldindata.org/coronavirus). This is extremely low compared to almost the entire pandemic.

  • covid19_scenarios

    Models of COVID-19 outbreak trajectories and hospital demand

  • InfluxDB

    Power Real-Time Data Analytics at Scale. Get real-time insights from all types of time series data with InfluxDB. Ingest, query, and analyze billions of data points in real-time with unbounded cardinality.

  • ncov

    Nextstrain build for novel coronavirus SARS-CoV-2

  • makair

    🫁 The world's first open-source ventilator tested on human patients. Mass-producible at a low cost (~2000€).

  • seirsplus

    Models of SEIRS epidemic dynamics with extensions, including network-structured populations, testing, contact tracing, and social distancing.

  • covariants

    Real-time updates and information about key SARS-CoV-2 variants, plus the scripts that generate this information.

    Project mention: At what point do you think things will change? | /r/ZeroCovidCommunity | 2023-12-08

    "Publicly available data on the number of analyzed sequences over two-week windows for each country were extracted from covariants.org and Global Initiative on Sharing All Influenza Data (GISAID) initiative databases [3, 4]."

  • serratus

    Ultra-deep search for novel viruses

  • WorkOS

    The modern identity platform for B2B SaaS. The APIs are flexible and easy-to-use, supporting authentication, user identity, and complex enterprise features like SSO and SCIM provisioning.

  • nextclade

    Viral genome alignment, mutation calling, clade assignment, quality checks and phylogenetic placement

    Project mention: Why does musl make my Rust code so slow? (2020) | news.ycombinator.com | 2023-12-12

  • COVID-19-Impfungen_in_Deutschland

    Gemäß Impfverordnung sind alle Impfdaten täglich dem Robert Koch Institut (RKI) zu melden. Die Impfkampagne wurde in ihrem Verlauf um immer weitere Leistungserbringer erweitert, für die mehrere Meldeportale eingerichtet wurden, die in diesem Dokument beschrieben werden.

  • SARS-CoV-2_variant-reports

    Informal summaries of notable SARS-CoV-2 lineages

  • social-distancing

    A simple, decentralized. privacy-reserving contact tracing system

  • covid19-eu-data

    Automated Data Collection: COVID-19/SARS-COV-2 Cases in EU by Country, State/Province/Local Authorities, and Date

  • COVID-19-Hospitalisierungen_in_Deutschland

    Im Datensatz 'COVID-19-Hospitalisierungen' werden die aktuellen Zahlen der nach den Vorgaben des Infektionsschutzgesetzes - IfSG - erfassten hospitalisierten COVID-19-Fälle bereitgestellt.

  • SARS-CoV-2-Infektionen_in_Deutschland_Archiv

    Der vorliegende Datansatz enthält umfassende Informationen zu SARS-CoV-2-Infektionen in Deutschland, die gemäß dem Infektionsschutzgesetze (IfSG) von den Gesundheitsämtern an das Robert Koch-Institut (RKI) gemeldet wurden. Die Daten umfassen Informationen zur Anzahl der bestätigten Fälle, Todesfälle und Genesungen.

  • SARS-CoV-2-Nowcasting_und_-R-Schaetzung

    Das Nowcasting erstellt eine Schätzung des Verlaufs der Anzahl von bereits erfolgten SARS-CoV-2-Erkrankungsfällen in Deutschland unter Berücksichtigung des Diagnose-, Melde- und Übermittlungsverzugs.

  • COVID-19-RNA-Seq-datasets

    A repository for sharing information on available COVID-19 RNA-Seq datasets

  • BioExplorer

    The Blue Brain BioExplorer (BBBE) is a tool for data visualization experts and scientists to extract and analyze scientific data from visualization and interactive exploration

  • PHES-ODM

    The Public Health Environmental Surveillance Open Data Model (PHES-ODM, or ODM). A data model, dictionary and support tools for environmental surveillance.

  • jaukerl-ooe

    Overview page for all COVID vaccination appointments in Upper Austria. 💉

  • SARS-CoV-2-Infektionen_in_Deutschland

    Der vorliegende Datansatz enthält umfassende Informationen zu SARS-CoV-2-Infektionen in Deutschland, die gemäß dem Infektionsschutzgesetze (IfSG) von den Gesundheitsämtern an das Robert Koch-Institut (RKI) gemeldet wurden. Die Daten umfassen Informationen zur Anzahl der bestätigten Fälle, Todesfälle und Genesungen.

  • helix-covid19db

    Helix® COVID-19 Surveillance

  • covid19-eu-data-api

    Clean up data

  • COVID-19-Todesfaelle_in_Deutschland

    Im Datensatz 'COVID-19-Todesfälle in Deutschland' werden die Todesfälle in Bezug auf COVID-19 in Deutschland bereitgestellt. Darüber hinaus wird neben der Anzahl der übermittelten Todesfälle der Fall-Verstorbenen-Anteil berechnet. Angaben zum Tod zählen zu den melde- und übermittlungspflichtigen Inhalten. Bei der Ermittlung von Todesfällen und...

  • SaaSHub

    SaaSHub - Software Alternatives and Reviews. SaaSHub helps you find the best software and product alternatives

NOTE: The open source projects on this list are ordered by number of github stars. The number of mentions indicates repo mentiontions in the last 12 Months or since we started tracking (Dec 2020). The latest post mention was on 2023-12-12.

sars-cov-2 related posts

Index

What are some of the best open-source sars-cov-2 projects? This list will help you:

Project Stars
1 covid-19-data 5,636
2 covid19_scenarios 1,366
3 ncov 1,351
4 makair 798
5 seirsplus 646
6 covariants 314
7 serratus 243
8 nextclade 196
9 COVID-19-Impfungen_in_Deutschland 168
10 SARS-CoV-2_variant-reports 99
11 social-distancing 88
12 covid19-eu-data 80
13 COVID-19-Hospitalisierungen_in_Deutschland 77
14 SARS-CoV-2-Infektionen_in_Deutschland_Archiv 76
15 SARS-CoV-2-Nowcasting_und_-R-Schaetzung 76
16 COVID-19-RNA-Seq-datasets 75
17 BioExplorer 62
18 PHES-ODM 51
19 jaukerl-ooe 29
20 SARS-CoV-2-Infektionen_in_Deutschland 23
21 helix-covid19db 16
22 covid19-eu-data-api 6
23 COVID-19-Todesfaelle_in_Deutschland 6

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